Прекращение лицензионного договора осуществляется по общим правилам, применимым к гражданско-правовым договорам, если иное не предусмотрено законодательством или характером исключительного права. Основные способы расторжения включают взаимное соглашение сторон, судебное разбирательство при существенном нарушении условий договора одной из сторон, а также односторонний отказ от договора в случаях, предусмотренных законом.

Основания для расторжения лицензионного договора подразделяются на общие и специальные. К общим основаниям относятся существенное нарушение договора одной из сторон или существенное изменение обстоятельств, из которых стороны исходили при его заключении. Специальные основания для прекращения договора могут быть установлены для конкретных видов лицензионных договоров. Например, патентообладатель имеет право требовать через суд прекращения действия принудительной простой лицензии, если обстоятельства, послужившие основанием для ее предоставления, перестали существовать и маловероятно их возникновение в будущем.

Односторонний отказ от лицензионного договора возможен в ряде случаев. Лицензиар вправе отказаться от договора, если лицензиат существенно нарушил обязанность по своевременной уплате лицензионного вознаграждения. Также односторонний отказ возможен, если лицензиат-издатель не приступил к использованию произведения в установленный срок или если лицензиат, получивший права по открытой лицензии, вышел за пределы предоставленных ему полномочий при распоряжении правами третьим лицам. Для лицензионных договоров в отношении ноу-хау, заключенных на неопределенный срок, как лицензиар, так и лицензиат имеют право на немотивированный односторонний отказ при условии соблюдения установленного срока уведомления.

Способы расторжения лицензионного договора аналогичны способам расторжения иных гражданско-правовых договоров: по соглашению сторон, в судебном порядке по требованию одной из сторон, или путем одностороннего отказа от договора. При одностороннем отказе от договора сторона, инициирующая расторжение, должна направить другой стороне письменное уведомление с указанием оснований для отказа, ссылаясь на нормы закона и/или положения договора. Договор, как правило, прекращается с момента получения уведомления другой стороной. Однако существуют исключения, например, при отказе лицензиара из-за неуплаты вознаграждения, договор прекращается по истечении 30 дней с момента получения уведомления, если задолженность не погашена.

Возврат лицензионного вознаграждения при расторжении договора зависит от его вида, условий договора и обстоятельств расторжения. В случае расторжения договора до начала использования объекта и при условии предварительной оплаты (аванса), возврат производится по общим правилам возврата аванса. Если договор исполнялся, и лицензиат принял право в пользование без замечаний, требование о возврате паушального взноса может быть не удовлетворено, если лицензиар не нарушал договор. Возврат роялти возможен, если они были перечислены авансом и договор расторгнут до наступления периода их начисления за фактическое использование.

В случае, если право использования объекта по лицензионному договору было зарегистрировано в Роспатенте, необходимо также зарегистрировать прекращение этого права.