Автономное учреждение представляет собой некоммерческую организацию, созданную государством или муниципалитетом для выполнения общественно значимых задач. Учредитель определяет для такого учреждения государственное или муниципальное задание. Имущество, которым располагает автономное учреждение, находится в собственности учредителя. Однако, по сравнению с бюджетными и казенными учреждениями, автономные учреждения обладают большей самостоятельностью в распоряжении своим имуществом, требуя согласия учредителя на сделки реже. Часть своего имущества автономное учреждение может использовать для погашения собственных долгов. Финансирование автономного учреждения осуществляется как за счет бюджетных средств, так и за счет собственной, приносящей доход деятельности.

Автономное учреждение является некоммерческой организацией, учрежденной государством или муниципалитетом, целью которой является выполнение работ и оказание услуг в рамках полномочий государственных органов, органов публичной власти федеральных территорий и органов местного самоуправления. Виды деятельности, которыми может заниматься учреждение, должны быть четко определены в его уставе и соответствовать целям его создания. Судебная практика трактует цели учреждения как полномочия органа, которому оно подведомственно. Сделки, заключенные учреждением вне рамок установленных целей, могут быть признаны недействительными.

Учредитель утверждает для автономного учреждения государственное или муниципальное задание. Невыполнение данного задания влечет ответственность должностных лиц учреждения в виде штрафа, предусмотренного статьей 15.15.5-1 КоАП РФ. Автономные учреждения также могут выполнять денежные публичные обязательства перед гражданами от имени учредителя, такие как выплаты стипендий или пособий, на основании отдельного приказа учредителя. Федеральные учреждения руководствуются Правилами, утвержденными Постановлением Правительства РФ от 02.08.2010 N 590, а региональные и муниципальные учреждения – соответствующими региональными и местными нормативными актами.

Правовой статус имущества автономного учреждения предполагает, что движимое и недвижимое имущество (за исключением земельных участков) находится у учреждения на праве оперативного управления, при этом собственником остается государство или муниципалитет. Распоряжение таким имуществом, включая его продажу или сдачу в аренду, как правило, требует проведения торгов и получения согласия собственника. Земельные участки предоставляются автономным учреждениям на праве постоянного (бессрочного) пользования. Учреждения могут использовать их для предоставления служебных наделов или установления сервитутов, но иное распоряжение земельными участками запрещено и может привести к признанию сделки недействительной.

Совершение крупных сделок и сделок с заинтересованностью автономным учреждением требует одобрения наблюдательного совета. Руководитель учреждения должен представить совету предложение, содержащее подробную информацию о сделке, включая ее вид, роль учреждения, сведения о торгах, данные о контрагенте, описание передаваемого имущества с указанием его балансовой стоимости, цену договора, характер заинтересованности и обоснование сделки. Наблюдательный совет обязан принять решение в течение 15 дней. В случае заинтересованности большинства членов совета в сделке, ее одобрение переходит к учредителю. Совершение сделки без необходимого одобрения может привести к ее признанию судом недействительной.

Закупки товаров, работ и услуг автономными учреждениями осуществляются в соответствии с Законом N 223-ФЗ, за исключением случаев, когда средства привлекаются для капитальных вложений в объекты публичной собственности, или когда полномочия по государственному или муниципальному заказу передаются учреждению безвозмездно по соглашению. Также, если учреждение не разместило положение о закупке в Единой информационной системе, оно обязано проводить закупки по Закону N 44-ФЗ. Нарушение установленного порядка закупок может повлечь административную ответственность для должностных лиц и самого учреждения.

Продажа и сдача в аренду имущества автономным учреждением, как правило, осуществляются посредством торгов. При отсутствии специальных нормативных актов, регулирующих продажу имущества учреждений, ФАС России рекомендует применять правила, установленные для торгов на право заключения договоров, предусматривающих переход прав владения и (или) пользования государственным или муниципальным имуществом. Сдача недвижимого имущества в аренду обычно проводится на аукционе или конкурсе.

Источниками финансирования автономных учреждений являются субсидии из бюджета, предоставляемые на выполнение государственного или муниципального задания, капитальные вложения, а также на иные цели. Нецелевое использование субсидий влечет обязанность вернуть средства в бюджет и может привести к привлечению к ответственности должностных лиц. Кроме того, автономные учреждения могут получать доход от собственной деятельности, такой как оказание услуг или использование имущества, при условии, что такая деятельность не противоречит уставным целям. Пожертвования от граждан и организаций также являются источником финансирования, при этом для договоров с организациями на сумму свыше 3 тыс. рублей требуется письменная форма.

Автономное учреждение несет ответственность по своим долгам всем своим имуществом, за исключением недвижимого и особо ценного движимого имущества, переданного собственником или приобретенного на его средства. Собственник имущества автономного учреждения несет субсидиарную ответственность по его обязательствам в соответствии с Гражданским кодексом РФ. Это включает ответственность по обязательствам, связанным с причинением вреда гражданам, или обязательствам, вытекающим из публичного договора при ликвидации учреждения, если имущества учреждения недостаточно для их исполнения.