Законодательство не устанавливает строгих требований к форме протокола разногласий к акту сверки взаиморасчетов, что позволяет составлять его в произвольном порядке. Для обеспечения ясности и полноты информации, помимо описания самих разногласий, рекомендуется указывать ссылки на документы, подтверждающие контекст спора. К таким документам относятся наименования сторон, реквизиты оспариваемого акта сверки, а также первичные документы, на основании которых были сформированы данные для сверки.

Протокол разногласий следует составлять в двух экземплярах. Подписание документа может осуществляться руководителем организации или уполномоченным лицом при наличии соответствующей доверенности. Наиболее частым подписантом является главный бухгалтер.

При составлении протокола разногласий рекомендуется включать следующие сведения:

номер, дату и место составления документа;

ссылку на акт сверки, включая дату его составления и получения;

указание на период, к которому относится сверка взаиморасчетов;

номер и дату договора, по которому проводится сверка;

наименования всех участвующих сторон;

детальное описание предмета разногласий с комментариями;

ссылки на соответствующие первичные документы;

предложения по внесению изменений в акт сверки;

должность и полные фамилия, имя, отчество лица, уполномоченного на подписание протокола;

номер и дату доверенности, если протокол подписывается представителем по доверенности.

Рекомендуется подготовить протокол разногласий в двух экземплярах: один для себя и один для контрагента. К экземпляру, направляемому контрагенту, следует приложить копии первичных документов, если расхождения связаны с ними. Например, для подтверждения неучтенного платежа могут быть приложены копия платежного поручения с отметкой банка или выписка с расчетного счета. Для подтверждения стоимости неучтенной услуги может быть приложена копия акта сдачи-приемки. Также может быть приложена копия доверенности, подтверждающая полномочия подписанта.

Подготовкой протокола разногласий обычно занимается бухгалтерия, а его проверкой – юрист. Подписывает документ, как правило, генеральный директор организации. В случае отсутствия генерального директора или по его поручению, протокол может быть подписан главным бухгалтером или другим сотрудником при наличии соответствующей доверенности.